Voltado a empresas de todos os portes, o programa oferece taxas diferenciadas conforme as diretrizes da nova política industrial, que dividiu os setores da economia em três eixos: programas mobilizadores em áreas estratégicas; programas para conciliar e expandir a liderança; e programas para fortalecer a competitividade.
Para o primeiro grupo, onde estão inseridos os complexos industriais de defesa, saúde, tecnologia da informação, energia nuclear e nanotecnologia, áreas consideradas estratégicas e prioritárias pelo governo, a taxa de correção dos contratos será de 4,25% ao ano. No segundo eixo, que engloba os setores de siderurgia, petróleo, gás natural, bioetanol, celulose e complexo aeronáutico, o percentual passa para 4,75%. Por último estão os setores de bens de capital, automotivo, têxtil, calçados e agroindústria, entre outros, que terão os seus contratos de financiamento corrigidos em 5,25% ao ano. Já os projetos que não se enquadram em nenhum dos três eixos da nova política terão taxa variável de TJLP mais 5% ao ano.
Em todos os contratos de financiamento realizados pelo Inova Brasil a Finep participa em até 90% do valor total do projeto. Cada empresa poderá pleitear até R$ 100 milhões, sendo R$ 1 milhão o valor mínimo de cada financiamento. Todas as empresas contratadas terão, ainda, prazo de até 100 meses para pagar o empréstimo, sendo 20 de carência e 80 para amortização. O prazo para liberação da primeira parcela do financiamento, a partir da aceitação do projeto pela Finep, será de cem dias.